Barangan haiwan digunakan di sesetengah rumusan Cina, yang dapat mewakili suatu masalah untuk vegans dan vegetarians. Jike diberitahukan sekatan seperti itu, para pengamal akan sering menggunakan bahan pilihan lain.

Amalan menggunakan spesis yang terancamen adalah berkontroversi dalam PTC. Banyak bahan-bahan berada di bawah kategori ini, dengan Materia Medicas moden seperti teks herba Cina komprehensif Bensky, Clavey dan Stoger mengurus dengan bahan-bahan berasal dari spesis yang terancam dalam suatu appendiks, dengan suatu emfasis pada pilihan lain yang dicadangkan.[46] Sesetengah mendakwa kegunaan bahan-bahan berasal dari haiwan, seperti kegunaan zakar harimau untuk impoten, tidak dapat dianggap benar, kerana bahan-bahan yang disoal tidak bermuncul dalam senarai bahan-bahan farmakopoeia[perlu rujukan]. Kegunaan tanduk badak sembu (xī jiǎo / 犀角) untuk "menyejukkan darah" telah digantikan dengan tanduk kerbau (shuǐ niú jiǎo / 水牛角) bermula dari mungkin 5 AM, dan hempedu lembu (bovine) (niú dǎn / 牛膽 / 牛胆) adalah suatu penggantian moden untuk hempedu beruang (ursine) (xíong dǎn / 熊膽 / 熊胆). Suatu ramuan seperti "rumpai kambing bertanduk" (yín yáng hoù / 淫羊藿) adalah ketaranya sebuah tumbuhan (Epimedium).

Kegunaan perubatan mempunyai kesan uatama pada penduduk kuda laut, yang dianggap suatu ramuan asas, dan digunakan untuk merawat kepelbagaian keadaan kelam-kabut, termsuk penyakit lelah, arteriosklerosis, incontinence, impoten, keadaan kelam kabut tiroid, penyakit kulit, tulang patah, penyakit jantung, dan juga untuk memudahkan kelahiran anak dan juga sebagai suatu afrodisiak.[47]

Sup sirip ikan jerung mengikut tradisi dianggap bermanfaat untuk kesihatan di Asia Timur, dan kedudukannya sebagau suatu hidangan "elit" telah membawa permintaan bersa dengan ketambahan kemewahan di China, tetapi ia pasti mempunyai kesan mengakibatkan kebinasaan pada penduduk ikan jerung[48].

Gerakan hak asasi haiwan menyatakan bahawa sedikit jawapan perubatan Cina tradisional masih menggunakan hempedu beruang (xíong dǎn). Sejak 1988, Kementerian Kesihatan Cina bermula mengawal hasilan ini, yang terdahulunya menggunakan beruang yang dibunuh sebelum musim dingin. Beruang-beruang itu sering dimuatkan dengan suatu jenis kateter tetap, yang lebih beruntung daripada membunuh beruang[49]. Rawatan itu sendiri dan khususnya pencabutan hempedu adalah sangat menyakitkan untuk beruang, dan menyebabkan kerosakan perut dan usus, sering akhirnya menyebabkan kematian mereka. Meskipun, oleh kerana perhatian antarabangsa pada isu-isu mengelilingi penuaiannya, hempedu kini sanfat jarang digunakan oleh para pengamal di luar China; hempedu pundi-pundi dari lembu (hempedu lembu / niú dǎn) dicadangkan sebagai suatu pengganti untuk ramuan ini.